استمرار دولت و سلطنت آیه و حدیث استخراج کنند، مجتهدانی ظهور کردند که به استنباط احکام مستقل از حکام دست می زدند. نهاد دین از نهاد دولت مستقل شد و همتا و همپا بلکه مقتدرتر از سلاطین قاجار علمای شیعه اقتدار یافتند. حوزه نفوذ شیخ مرتضی انصاری میرزای شیرازی و آخوند خراسانی از ناصر الدین شاه مظفر الدین شاه و محمد علی شاه بیشتر شد و انقلاب مشروطه شکل گرفت، چون دین از دولت فربه تر بود. سومین رقابت در فکر شیعه میان سه حوزه فقهی بود. اول حوزه هزار ساله نجف که وارث مکتب سامرا هم بود و در عصر آخوند خراسانی به اقتدار اجتماعی بی سابقه ای رسید و رهبری سیاسی و مذهبی مردم ایران را در پایان عصر قاجار بر عهده گرفت. این حوزه از نظریه سیاسی ویژه ای پیروی میکرد که مدار آن نظارت فقیه بود. این نظریه سیاسی مستقیماً از فقه می آمد فقها شأن خود را تقنین می دانستند و برای خود مقام اجرا قائل نبودند و به استقلال مقام قضا از اجرا هم باور داشتند. دوم حوزه دو صد ساله قم بود که همزمان با استقرار قاجاریه و با تأسیس فیضیه شکل گرفت. همزمان با استقرار سلطنت پهلوی احیا شد - شیخ عبدالکریم حائری یزدی آن را زنده کرد - و در عصر آیت الله بروجردی به اوج اقتدار خود رسید. حوزه قم نیز در آغاز تحت تأثیر مکتب نجف از نظریه نظارت فقیه متأثر بود و آن را در دوره مرحوم بروجردی در عمل هم پیاده کرد، اما بعداً از اقتدار این نظر در قم کاسته شد و حداقل از نظر سیاسی با ظهور علمایی مانند آیت الله خمینی و آیت الله منتظری نظریه ولایت فقیه قدرت گرفت. به جز این دو حوزه بزرگ از میان دیگر حوزه های فکر و فقه شیعه تنها حوزة علمیه مشهد توانست استقلال گفتمانی خود را تا امروز حفظ کند. حوزه اصفهان با زوال صفویه رو به افول رفت و با وجود حفظ استقلال اداری خود از نظر گفتمانی در حاشية حوزه علميه قم قرار گرفت چنانکه حوزه سامرا پس از میرزای شیرازی اقول کرد و از نظر گفتمانی ذیل حوزه علمیه نجف قرار گرفت. حوزه های علمیه تهران هم با وجود تأسیس حکومت دینی هرگز نتوانستند سیادت فقهی مکتب تهران را بر حوزه های قم و نجف حاکم کنند هر چند که سیادت سیاسی یافتند. 

مجموعه نقد الهیات سیاسی

جلد اول تراژدی پرونستانتیسم اسلامی

پژوهشی انتقادی در اندیت سیاسی نهضت اصلاح دینی در ایران

جاد دوم پارادوکس مارکسیسم اسلامی ژوهشی انتقادی در بیمارستانی حسن جب اسلامی در ایران

جلد سوم ظهور لوبانان اسلامی پژوهشی تاریخی در تکوین نظر ولی دولت مدرن در قله سیاسی شیعه

جلد چهارم: مصائب لیبرالیسم اسلامی پژوهشی راهبردی در مواقع تاسیس جنبش آزادی خواهی در فرش

جلد پنجم: بحران بورژوازی اسلامی ژوهشی راهبردی در موقع تاسیس جلیش توسعه ی ایران