در کتاب داستان پیامبران در کلیات شمس نویسنده به شرح و تفسیر عرفانی داستان‌ها در غزل‌های مولوی پرداخته است. این کتاب داستان‌های آدم، ابراهیم، ادریس، ایوب، جرجیس، خضر، الیاس، داوود، سلیمان، صالح، عیسی و لوط را روایت می‌کند. در طرح کلی این کتاب، داستان پیامبران بر حسب نام پیامبران، به‌ترتیب حروف الفبا آمده است. هر داستان شامل دو بخش مجزاست. بخش اول شامل نقل همه‌ی شواهد به تفکیک موضوع، و شرح و توضیح هر گروه از شواهد هم‌موضوع، با مراجعه به قرآن کریم و تفاسیر است. بخش دوم تفسیر داستان است. در این بخش ابیاتی که معنی آن با توضیح اشاره‌های داستانی روشن نمی‌شود و معنی مجازی و رمزی دارد، به ترتیبی که در بخش اول آمده است، مطرح می‌شود و با استفاده از دیگر آثار مولوی، به‌خصوص مثنوی و نیز آثار عرفانی منظوم و منثور دیگر، اغلب متعلق به زمان‌های پیش از مولوی، تفسیر می‌شود. در این تفسیرها سعی بر آن است که با استفاده از شواهد متعدد، هم در زمینه‌ی فکر و هم در زمینه‌ی تصویر، یکی از تفسیرهای ممکن، باب امکان تفسیرهای دیگر و ورود به باطن شعر گشوده گردد. مطالعه‌ی این کتاب ارزشمند به همه‌ی علاقه‌مندان ادب فارسی توصیه می‌شود.